Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42EP5Q6NZY7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms