Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LCN10Q6JVE6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LCN10Q6JVE6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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