Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL3Q6DD88 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATL3Q6DD88 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms