Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG16L1Q676U5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG16L1Q676U5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms