Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF123Q5XPI4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF123Q5XPI4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms