Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USPL1Q5W0Q7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USPL1Q5W0Q7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms