Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CARMIL1Q5VZK9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms