Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SUSD4Q5VX71 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SUSD4Q5VX71 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms