Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LRCH2Q5VUJ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRCH2Q5VUJ6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms