Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1BQ5VTD9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFI1BQ5VTD9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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