Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYT6Q5T7P8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT6Q5T7P8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms