Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC183Q5T5S1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms