Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP70Q5T0N1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms