Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
CATSPEREQ5SY80 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CATSPEREQ5SY80 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms