Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC39AQ5SRH9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms