Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FRMPD3Q5JV73 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FRMPD3Q5JV73 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms