Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
C9orf116Q5BN46 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
C9orf116Q5BN46 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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