Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF2Q5BJF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF2Q5BJF6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms