Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RPL39P5Q59GN2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RPL39P5Q59GN2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms