Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RPEL1Q2QD12 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPEL1Q2QD12 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms