Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MICAQ29983 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MICAQ29983 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MICAQ29983 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MICAQ29983 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms