Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFKFB3Q16875 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms