Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTN1Q16799 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RTN1Q16799 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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