Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FXNQ16595 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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FXNQ16595 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FXNQ16595 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FXNQ16595 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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