Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC18A3Q16572 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC18A3Q16572 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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