Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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