Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK5Q16478 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIK5Q16478 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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