Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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