Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS72Q15906 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS72Q15906 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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