Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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