Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NPTX1Q15818 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NPTX1Q15818 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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