Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNHIT3Q15649 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNHIT3Q15649 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms