Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKIV2LQ15477 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms