Protein–RNA interactions for Protein: Q15303

ERBB4, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB4Q15303 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
ERBB4Q15303 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERBB4Q15303 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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