Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NECTIN1Q15223 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NECTIN1Q15223 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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