Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PCLAFQ15004 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PCLAFQ15004 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms