Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GAPVD1Q14C86 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GAPVD1Q14C86 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
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