Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IHHQ14623 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IHHQ14623 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms