Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL9A2Q14055 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
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COL9A2Q14055 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL9A2Q14055 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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