Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CDK13Q14004 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CDK13Q14004 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
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