Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RUNX2Q13950 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RUNX2Q13950 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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