Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PKP1Q13835 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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