Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LSAMPQ13449 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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