Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SCGB2A2Q13296 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SCGB2A2Q13296 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms