Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LCP2Q13094 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms