Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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BNIP3Q12983 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BNIP3Q12983 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BNIP3Q12983 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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