Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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