Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CDH17Q12864 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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