Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPSF1Q10570 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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