Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC15Q0P6D6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms